Nama Urutan Kepala SMK Marsudirini St. Fransiskus Semarang :
- Dra. Sr. M. Beatrix, OSF, M.M ( tahun 1989 – 1998)
- Sr. M. Willybrodie, OSF ( tahun 1998 – 1999)
- Sr. M Paula, OSF, S.Ag ( tahun 1999 – 2003)
- Sr. M. Helena, OSF, S.Pd ( tahun 2003 – 2007)
- Dra. Sr. M. Beatrix, OSF, M.M ( tahun 2007 – 2009)
- Sr. M. Margaretha, OSF, S.Pd ( tahun 2009 – 2016)
- Sr. M. Paulina, OSF, S.Pd, M.M ( tahun 2016 – 2019)
- Yohanes Sudarna, S.Pd, M. M. ( tahun 2019 – sekarang)